MovableType4のテンプレートモジュールを編集して保存すると内容が途中で消えてしまうのですが？

あるいは、テンプレートモジュールの内容をテキストエディターにコピー＆ペーストして、エディター上で編集してから再度、MT4管理画面に貼り付けるのも安心です。

なお、テンプレートをエディターにコピー＆ペーストする際は、「強調表示なし」の設定にしていないと改行コードが挿入されないので見づらくなるので注意しましょう。

無料のツールでAreaEditorというのがありますが、これを使うと、とても便利ですよ。

是非、お試しください。